第 13 章 多重检验
对应原书 Chapter 13: Multiple Testing。
本章定位
本章讨论当我们同时做大量假设检验时,错误发现会如何累积,以及如何控制家族错误率和错误发现率。
阅读前问题
- 单个假设检验中的 I 类错误和 II 类错误是什么?
- 为什么检验次数一多,假阳性会迅速增加?
- FWER 和 FDR 分别控制什么?
- Benjamini-Hochberg 程序的直觉是什么?
章节骨架
- 假设检验快速回顾
- 多重检验的挑战
- 家族错误率 FWER
- 错误发现率 FDR
- 重采样方法
- Python 多重检验实验
核心概念
- 原假设
- 备择假设
- p 值
- I 类错误
- II 类错误
- 检验功效
- FWER
- FDR
- Bonferroni 校正
- Benjamini-Hochberg 程序
公式与推导
重点补充:
- p 值定义
- FWER
- FDR
- Bonferroni 校正
- BH 程序
- 重采样 p 值思想
图表与直觉
图片放在:
assets/images/ch13/
建议补充:
- 多重检验错误累积示意图
- FWER 与 FDR 对比图
- BH 程序排序图
- p 值分布图
Python 实验
记录:
- 假设检验回顾
- FWER 控制
- FDR 控制
- 重采样方法
习题与思考
- 什么时候应更关注 FWER?
- 什么时候 FDR 更合适?
- 多重检验和机器学习中的特征筛选有什么关系?
与前后章节联系
本章与统计推断关系更密切,也能和高维数据、基因表达数据分析联系起来。
待补充
- 整理 FWER 与 FDR 对比表。
- 补充 BH 程序步骤。
- 复现实验中的 p 值分布图。